Fluoresoivat väriaineet ovat yhdisteitä, joilla on erityiset rakenteet, ja niiden rakenteelliset ominaisuudet sisältävät pääasiassa seuraavat kolme kohtaa:
(1) Molekyyli sisältää fluoresoivaa lähettävää ryhmää, kuten karbonyyliryhmää, typen ja typen kaksoissalpausta, hiili-typpi-kaksoissidaattia jne.
(2) Molekyyli sisältää apulaitteita. Auxochrome-ryhmä tekee spektristä punaisen muutoksen ja lisää fluoresenssitehokkuutta, kuten ensisijainen aminoryhmä, toissijainen aminoryhmä, hydroksyyliryhmä, eetterisside, amidiryhmä ja niin edelleen.
(3) Molekyyli sisältää konjugoituja π, joilla on jäykkä planaarinen rakenne. Mitä suurempi on intramolekulaarinen konjuged-järjestelmä, sitä vahvempi on planarity, sitä suurempi fluoresenssin voimakkuus. Jotkin tekijät, jotka voivat parantaa konjugaatioastetta, voivat lisätä fluoresenssitehokkuutta ja siirtää fluoresenssin aallonpituutta pitkän aallon suuntaan.
